Peut-on personnaliser le thème au niveau des TPL et CSS ?

Oui, bien sûr.

AU niveau de la structure du code de base, le thème par défault du EVO6 se rapproche beaucoup du thème par défault

Si pour une raison X ou Y vous avez envie de changer le code source du thème EVO6, libre a vous de le faire, cela n’affectera pas les fonctionnalités du module.